注冊資本是公司股東對公司債權人責任的限額，在公司成立之初，公司的注冊資本額等于股東權益額。之后，由于公司經營業績的不同，股東權益額與注冊資本變化的方向不同：如果公司盈利，股東權益額向著大于注冊資本額的方向變化；如果公司虧損，股東權益額向著小于注冊資本的方向變化。因此，從規則上說，是允許因公司經營的原因使股東對債權人的責任額小于公司注冊資本額的。；那么，在公司合并的情況下，應當如何處理參加合并的各公司的注冊資本額與合并后公司的注冊資本呢？首先，這不是一個財務問題，也不是一個商業問題，只是一個公司法律制度問題。也就是在公司合并的情況下，如何處理合并前各公司股東對公司債權人的責任額與合并后公司股東對公司債權人的責任額問題；其次，如果這個分析是對的，合并后公司股東對債權人的責任額就應當等于參加合并的各公司股東對債權人責任額之和；最后，在合并過程中，公司通知了債權人并且進行了公告，債權人享有了與公司減資相同的權利，即有權要求公司償還債務或者提供相應的擔保，如此說來如果合并后的公司的注冊資本額，即合并后公司股東對債權人的責任額小于參加合并的各公司注冊資本之和，也不能認為侵犯了債權人的利益。據此，合并后公司的注冊資本額應當等于或者小于參加合并的各公司注冊資本之和。
關于合并后存續或者新設公司的注冊資本額，國家工商總局在其《關于做好公司合并分立登記支持企業兼并重組的意見》第5條中明確，支持公司自主約定合并后公司的注冊資本額，因合并而存續或者新設的公司，其注冊資本、實資本數額由合并協議約定，但不得高于合并前各公司的資本之和。

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