企業的獨立法人地位和經營運行是通過一定的組織結構和權利結構來實現的，而一定的組織結構和權利結構的安排則由企業組織制度決定。企業組織制度的主要法律形式是現代公司制，其特征主要有：第一，為了保證眾多出資者權利的履行，在組織制度上需要引某些民主表決原則或投票程序，如股東代表大會就是通過民主程序執行和保障每個出資人權利的組織機構，也是公司的最高機構。第二，由于資人的資本金投入企業后便形成企業法人財產，因而要有一個相應的使企業法人財產權的組織機構，這一組織機構的形成是以董事信托責任制度為基礎的，即股東以對董事的信任為基礎，委托董事經營公司的法人財產，董事則以公司利益為唯一的行為準則。在股東會閉會期間，董事會代表全體股東行使權利，是公司的日常權利機構和法定代表機構。第，隨著現代經營活動的專業化，董事會把企業長期發展的管理交給職業經理負責，而其本身只行使對經理的監督權，從而形成所有權和管理權相分離的組織制度。經理層既統一主持公司的日常經營和管理，又決定公司長期發展的目標與政策。第四，隨著U型公司組織結構向M型公司組織結構的演變，經理層管理出現了日常經營活動與發展戰略規劃的分離，而形成了中層管理決策與高層管理決策分權型的企業組織制度，即事部管理體制的組織制度。第五，為了對董事會和經理班子行使職權進監督，通常還設立監事會這一組織機構，它對股東會負責，依法和依照司章程對公司的經營活動進行監督，審核與檢查公司的財務和資產狀況等。