第一，研究開發投入與產出缺乏強相關性，即使研發成功，研發成果也相對缺乏國際競爭力。

實踐表明．我國高新技術企業研發投入和研發產出存在弱相關性，企業花在研究開發活動的費用太多是無效的，并沒有直接轉化為企業的技術資產。高新技術產業具有高風險特征，高技術企業具有極高的技術風險、市場風險和財務風險，企業研究開發失敗的概率比較大。

“二八”原則在高新技術企業研究活動中的作用非常明顯，即“20％-30％的高新技術產業化的巨大成功是以70％-80％的高新技術企業的失敗作為代價的。研發活動其有高風險性，任正非坦言“研發是很費錢的事”，“研發要做就要做大，小打小鬧不如不做”。

雖然我國高新技術企業自主創新活動相當廣泛，研發力度較大，但是大多為“小打小鬧”型企業，自主創新能力提升甚微，自主創新效益不夠明顯．往往半途而廢．最終放棄技術，將重點轉向了品牌管理。即使企業研發成功，研發成果也相對缺乏國際競爭力。總體看中國高新技術產業在國際產業分工中仍處于較低層次。

第二，研究開發投入對自主創新能力建設的貢獻率比較低，產學研分離，投入不能有效的轉化為產出。

我國高新技術企業研究開發規模不斷擴大，投入強度屢創歷史最高水平。然而．相對投入的高發展，我國科技投入產出則顯滯后。

根據國家科技部的《中國高新披術企業自主創新能力分析報告》，我國每年取得科技成果的轉化率只有20％左右，形成規模效益的只有15％．約80％處于閑置狀態。而且這20％轉化的科技成果所生產的一半以上尚處于通過外延擴張的發展態勢，在產業鏈延伸、附加值提高方面仍有待進一步的加強。

第三，中國高新技術企業普遍缺乏持續成長的能力，由持續的資金投入引起的財務風險較大，限制我國高新技術企業發展的主要瓶頸之一是缺乏有效的金融支持環境。

一方面，高新技術企業所需研究開發成本較高．自身難以獨立承擔。新技術產業具有高投入、高風險和高收益等特點．其發展過程對資余的需求量很大，其成本是傳統企業的10倍-20倍。前期研發費用高，世界領域內的一些大規模企業的研發費用動輒就在每年幾十億美元以上，后期科技成果轉化等所需要的費用更是呈l倍百倍的增加，任何個商新技術倉業都難以獨立承擔。

另一方面，我國高新技術企業資金來源渠道窄，企業財務缺乏持續能力而導致技術創新失般的風險非常大。我國高新技術企業起步晚，企業規模較小，所有者投入資本小，加上后期自我積累能力低，企業自身資金實力較低。風險投資業在國內剛剛起步，無法提供充足的資金支持高新技水企業的成長。同時，由于缺少為高新企業融資的擔保機構．致使處于創業初期與成長階段的高新技術企業融資普遍困難，很難取得規模經濟效益。

加上在經營過程中，沒有及時納入國家扶持計劃．得不到國家資金的強有力支持，高新技術企業普遍缺乏資金來源，而技術自身的特點以及科學技術更新速度呈趨快趨勢，對企業研發的持續性要求非常高，因此由于缺乏資金來源導致技術創新失敗的風險非常太。

第四，我國高新技術企業管理能力普遍較低，制約高新技術企業發展。

不同管理模式對高新技術企業自豐創新能力育較大影響，自主創新能力與企業管理能力證相關。企業的技術創新活動從立項到最終產品銷售到企業日常管理過程的環節中，任何一個環節出錯都能導致失敗。

任何一項技術，即使設計無缺陷，企業管理水平的落后也會使其無疾而終。我國高新技術企業規模普遍較小，管理水平落后．嚴重限制了高新技術企業的發展。