如果說受理程序相當于人民法院民事案件的受理立案程，則接下來進入的審查程序就相當于法院的開庭審理程序。公司登記的審查程序是公司登記程序十分關鍵而又十分復雜的程序，需要對公司登記申請提供的文件和材料的本身及其反映的內容逐項作詳細、具體的審核，以判斷登記申請是否真實、是否合法。公司登記機關對登記申請進行審查應當遵循什么樣的原則？對此，理論上有三種立法主張，即實質審查主義、形式審查主義和折中審查主義。

我們認為，堅持公司登記機關對登記申請的實質審查主義是我國立法的正確選擇。當然，為了克服實質審查主義的不足，我們可以對相關的制度和程序進行一些改良，如在公司法中降低設立公司的實體條件；盡量減少前置行政審批，也可以考慮將必要的行政審批后置；簡化登記申請的一些不必要的文書材料；適當縮短登記審查的期限；促成登記人員的專業化，實質提高審查效率等等。

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